Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DKK2Q9UBU2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms