Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms