Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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