Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms