Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NLE1Q9NVX2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
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