Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3EQ9NVU0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms