Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms