Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms