Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms