Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX3

NDUFA4L2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 4-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA4L2Q9NRX3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms