Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms