Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CNGB3Q9NQW8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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CNGB3Q9NQW8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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CNGB3Q9NQW8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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CNGB3Q9NQW8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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CNGB3Q9NQW8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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CNGB3Q9NQW8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
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CNGB3Q9NQW8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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CNGB3Q9NQW8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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CNGB3Q9NQW8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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CNGB3Q9NQW8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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CNGB3Q9NQW8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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CNGB3Q9NQW8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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CNGB3Q9NQW8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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CNGB3Q9NQW8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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CNGB3Q9NQW8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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CNGB3Q9NQW8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
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CNGB3Q9NQW8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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CNGB3Q9NQW8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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CNGB3Q9NQW8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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