Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms