Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB3

CABP2, Calcium-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP2Q9NPB3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms