Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD87

C6orf50, Putative uncharacterized protein C6orf50, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf50Q9HD87 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf50Q9HD87 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms