Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KIAA1549Q9HCM3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms