Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ3

RAVER2, Ribonucleoprotein PTB-binding 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAVER2Q9HCJ3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAVER2Q9HCJ3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms