Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNRC6CQ9HCJ0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNRC6CQ9HCJ0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNRC6CQ9HCJ0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNRC6CQ9HCJ0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNRC6CQ9HCJ0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNRC6CQ9HCJ0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TNRC6CQ9HCJ0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNRC6CQ9HCJ0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNRC6CQ9HCJ0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNRC6CQ9HCJ0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNRC6CQ9HCJ0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TNRC6CQ9HCJ0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TNRC6CQ9HCJ0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNRC6CQ9HCJ0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNRC6CQ9HCJ0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNRC6CQ9HCJ0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNRC6CQ9HCJ0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNRC6CQ9HCJ0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TNRC6CQ9HCJ0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TNRC6CQ9HCJ0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNRC6CQ9HCJ0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms