Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms