Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms