Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms