Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SENP6Q9GZR1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms