Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA4CQ9C0C4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA4CQ9C0C4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms