Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms