Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms