Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A5Q9BY07 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms