Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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