Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB6Q9BUF5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB6Q9BUF5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB6Q9BUF5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB6Q9BUF5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB6Q9BUF5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB6Q9BUF5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TUBB6Q9BUF5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms