Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAGR1Q9BTK6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms