Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms