Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms