Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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TM2D3Q9BRN9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TM2D3Q9BRN9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TM2D3Q9BRN9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TM2D3Q9BRN9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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