Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms