Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMSS1Q9BQ75 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMSS1Q9BQ75 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMSS1Q9BQ75 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMSS1Q9BQ75 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMSS1Q9BQ75 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMSS1Q9BQ75 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMSS1Q9BQ75 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMSS1Q9BQ75 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMSS1Q9BQ75 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMSS1Q9BQ75 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMSS1Q9BQ75 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMSS1Q9BQ75 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMSS1Q9BQ75 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CMSS1Q9BQ75 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CMSS1Q9BQ75 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMSS1Q9BQ75 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMSS1Q9BQ75 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMSS1Q9BQ75 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMSS1Q9BQ75 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms