Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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