Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms