Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms