Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms