Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms