Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK5RAP2Q96SN8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK5RAP2Q96SN8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK5RAP2Q96SN8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK5RAP2Q96SN8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK5RAP2Q96SN8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK5RAP2Q96SN8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK5RAP2Q96SN8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK5RAP2Q96SN8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK5RAP2Q96SN8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK5RAP2Q96SN8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK5RAP2Q96SN8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK5RAP2Q96SN8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK5RAP2Q96SN8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK5RAP2Q96SN8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK5RAP2Q96SN8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK5RAP2Q96SN8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK5RAP2Q96SN8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK5RAP2Q96SN8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK5RAP2Q96SN8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK5RAP2Q96SN8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK5RAP2Q96SN8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK5RAP2Q96SN8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK5RAP2Q96SN8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK5RAP2Q96SN8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK5RAP2Q96SN8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK5RAP2Q96SN8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK5RAP2Q96SN8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK5RAP2Q96SN8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK5RAP2Q96SN8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK5RAP2Q96SN8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK5RAP2Q96SN8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK5RAP2Q96SN8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms