Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCT8L2Q96SF2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT8L2Q96SF2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms