Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms