Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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