Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
LRRC7Q96NW7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC7Q96NW7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC7Q96NW7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC7Q96NW7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC7Q96NW7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC7Q96NW7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC7Q96NW7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC7Q96NW7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC7Q96NW7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC7Q96NW7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC7Q96NW7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC7Q96NW7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC7Q96NW7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms