Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms