Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NSMCE3Q96MG7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms