Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms