Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX27Q96L92 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX27Q96L92 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX27Q96L92 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX27Q96L92 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX27Q96L92 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX27Q96L92 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX27Q96L92 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX27Q96L92 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX27Q96L92 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX27Q96L92 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX27Q96L92 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX27Q96L92 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX27Q96L92 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX27Q96L92 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX27Q96L92 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX27Q96L92 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX27Q96L92 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX27Q96L92 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX27Q96L92 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX27Q96L92 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX27Q96L92 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms