Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms