Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAX2Q96IS3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAX2Q96IS3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAX2Q96IS3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAX2Q96IS3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAX2Q96IS3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAX2Q96IS3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RAX2Q96IS3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAX2Q96IS3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAX2Q96IS3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAX2Q96IS3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAX2Q96IS3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAX2Q96IS3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAX2Q96IS3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAX2Q96IS3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RAX2Q96IS3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAX2Q96IS3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAX2Q96IS3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAX2Q96IS3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAX2Q96IS3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms